雖然各航線都有專責的客輪，但船公司有時也會因為任務調度行駛的客輪；票價皆依原預訂的航線為準。
#各船公司票價均已包含政府規定的250萬旅客乘客險、30萬傷害醫療險
恆星號 大發輪船 大型高速客輪
元老級蘭嶼航線客輪，於2020年改為航行台南將軍港往返澎湖七美，已無全線支援蘭嶼航線。
| 船公司 | 大發輪船股份有限公司 |
| 聯絡電話 | |
| 船型 | 單體鋁合金客輪 |
| 載客人數 | 195人 |
| 船寬 | 7.8M |
| 船長 | 39.70M |
排班客輪
綠島航線由帆利航運、長杰航運、龍鴻航運3家船公司共同排班，乘客無法指定所搭乘之船隻，皆統一由其所組成之船班合作中心調度派發船班為主。
提供台東往返綠島的船運服務有凱旋2號、天王星、 綠島之星、綠島之星2號，所有客輪簡介如本頁以下介紹。
| 船公司 | 綠島聯合訂票中心 |
| 聯絡電話 | |
| 船型 | 單體/雙體高速鋁合金客輪 |
| 載客人數 | 300人 |
凱旋二號
推進器採KAMAWA噴射水式推進系統，以及輕鋁合金之船體構造，並搭配兩具水中平衡翼穩定器，能有效增加船體浮力與減少船體阻力
船公司 : 帆利航運有限公司
建造年月 : 1991年4月
載客人數 : 320人
船速 : 38~41節
主機 : MTU-V-16型(BENE) 2700HPX2
總噸位 : 476噸
船身尺寸 : 長40.0.公尺 寬10.0公尺 模深 3.0公尺
| 船公司 | 綠島聯合訂票中心 |
| 聯絡電話 | |
| 船型 | 雙體高速鋁合金客輪 |
| 載客人數 | 320人 |
天王星
雙體高速鋁合金客輪，推進系統採水噴射式設計
船公司 : 長杰航運股份有限公司
建造年月 : 1993年3月
載客人數 : 323人
船速 : 36節
總噸位 : 446噸
船身尺寸 : 長43.2.公尺 寬10.8公尺 模深 3.49公尺
| 船公司 | 綠島聯合訂票中心 |
| 聯絡電話 | |
| 船型 | 雙體高速鋁合金客輪 |
| 載客人數 | 323人 |
綠島之星
由日本於2003年12月建造，2012年自韓國引進台灣，船底為V形鋁合金設計，推進系統採水噴射式設計
船公司 : 龍鴻航運股份有限公司
載客人數 : 253人
引擎馬力 : 2,000匹
船速 : 30節
總噸位 : 270噸
船身尺寸 : 長34.15公尺 寬6.8公尺 模深 3.0公尺
| 船公司 | 綠島聯合訂票中心 |
| 聯絡電話 | |
| 船型 | 單體高速鋁合金客輪 |
| 載客人數 | 253人 |
綠島之星二號
由日本於1992年5月建造，2002年引進台灣，推進系統採水噴射式設計
船公司 : 龍鴻航運股份有限公司
載客人數 : 317人
引擎馬力 : 5292kw
船速 : 39節
總噸位 : 270噸
船身尺寸 : 長34.15公尺 寬6.80公尺 模深 3.00公尺
| 船公司 | 綠島聯合訂票中心 |
| 聯絡電話 | |
| 船型 | 雙體高速鋁合金客輪 |
| 載客人數 | 317人 |
